Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms