Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpcsQ8VDG5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms