Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r200Q8R281 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r200Q8R281 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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