Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms