Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms