Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dclre1bQ8C7W7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms