Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Usp20Q8C6M1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Usp20Q8C6M1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Usp20Q8C6M1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Usp20Q8C6M1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Usp20Q8C6M1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Usp20Q8C6M1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Usp20Q8C6M1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Usp20Q8C6M1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Usp20Q8C6M1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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