Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Shc4Q6S5L9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shc4Q6S5L9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms