Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcaf3Q6QR59 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcaf3Q6QR59 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms