Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc57Q6PHN1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc57Q6PHN1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms