Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp12Q6P5B0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp12Q6P5B0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp12Q6P5B0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp12Q6P5B0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp12Q6P5B0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp12Q6P5B0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp12Q6P5B0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp12Q6P5B0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp12Q6P5B0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp12Q6P5B0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp12Q6P5B0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms