Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CARMIL2Q6F5E8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms