Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpaQ62189 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpaQ62189 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms