Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmelQ60696 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmelQ60696 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms