Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srek1ip1Q4V9W2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srek1ip1Q4V9W2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms