Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Khdc1cQ4KL78 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Khdc1cQ4KL78 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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