Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms