Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pnpla6Q3TRM4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnpla6Q3TRM4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms