Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fndc4Q3TR08 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Fndc4Q3TR08 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fndc4Q3TR08 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Fndc4Q3TR08 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fndc4Q3TR08 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Fndc4Q3TR08 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fndc4Q3TR08 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fndc4Q3TR08 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fndc4Q3TR08 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Fndc4Q3TR08 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fndc4Q3TR08 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Fndc4Q3TR08 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Fndc4Q3TR08 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Fndc4Q3TR08 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Fndc4Q3TR08 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Fndc4Q3TR08 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc4Q3TR08 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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