Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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