Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn2Q08093 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms