Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax5Q02650 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms