Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms