Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RykQ01887 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RykQ01887 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RykQ01887 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RykQ01887 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RykQ01887 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RykQ01887 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RykQ01887 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RykQ01887 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RykQ01887 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RykQ01887 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RykQ01887 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RykQ01887 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RykQ01887 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RykQ01887 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RykQ01887 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RykQ01887 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RykQ01887 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RykQ01887 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RykQ01887 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RykQ01887 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RykQ01887 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RykQ01887 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RykQ01887 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RykQ01887 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RykQ01887 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RykQ01887 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RykQ01887 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms