Protein–RNA interactions for Protein: P70387

Hfe, Hereditary hemochromatosis protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HfeP70387 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HfeP70387 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HfeP70387 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HfeP70387 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HfeP70387 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HfeP70387 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HfeP70387 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HfeP70387 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HfeP70387 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HfeP70387 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HfeP70387 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HfeP70387 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HfeP70387 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HfeP70387 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HfeP70387 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HfeP70387 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HfeP70387 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HfeP70387 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HfeP70387 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HfeP70387 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HfeP70387 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HfeP70387 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HfeP70387 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms