Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sycp3P70281 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms