Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nup43P59235 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nup43P59235 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nup43P59235 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nup43P59235 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nup43P59235 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nup43P59235 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nup43P59235 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nup43P59235 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nup43P59235 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nup43P59235 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms