Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms