Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms