Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSEN1P49768 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN1P49768 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms