Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Defa1P11477 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa1P11477 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa1P11477 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Defa1P11477 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa1P11477 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.8 ms