Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB3P05106 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms