Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pik3cdO35904 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pik3cdO35904 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms