Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN3O15551 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms