Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CTDSP2O14595 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms