Protein–RNA interactions for Protein: F6QKH6

Lipo5, Lipase, member O5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo5F6QKH6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lipo5F6QKH6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lipo5F6QKH6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lipo5F6QKH6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lipo5F6QKH6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lipo5F6QKH6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lipo5F6QKH6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lipo5F6QKH6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lipo5F6QKH6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lipo5F6QKH6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms