Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms