Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d2A3KG59 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pm20d2A3KG59 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms