Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Btbd35f28A2CFD5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Btbd35f28A2CFD5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Btbd35f28A2CFD5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Btbd35f28A2CFD5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Btbd35f28A2CFD5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Btbd35f28A2CFD5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Btbd35f28A2CFD5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Btbd35f28A2CFD5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Btbd35f28A2CFD5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms