Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xlr4aA2BI40 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms