Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms