Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms