Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Knop1Q9Z2Q2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Knop1Q9Z2Q2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Knop1Q9Z2Q2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Knop1Q9Z2Q2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Knop1Q9Z2Q2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Knop1Q9Z2Q2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Knop1Q9Z2Q2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Knop1Q9Z2Q2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Knop1Q9Z2Q2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Knop1Q9Z2Q2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Knop1Q9Z2Q2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Knop1Q9Z2Q2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Knop1Q9Z2Q2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Knop1Q9Z2Q2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Knop1Q9Z2Q2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Knop1Q9Z2Q2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Knop1Q9Z2Q2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Knop1Q9Z2Q2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Knop1Q9Z2Q2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Knop1Q9Z2Q2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Knop1Q9Z2Q2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Knop1Q9Z2Q2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Knop1Q9Z2Q2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Knop1Q9Z2Q2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Knop1Q9Z2Q2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Knop1Q9Z2Q2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Knop1Q9Z2Q2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Knop1Q9Z2Q2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Knop1Q9Z2Q2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Knop1Q9Z2Q2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Knop1Q9Z2Q2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Knop1Q9Z2Q2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Knop1Q9Z2Q2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Knop1Q9Z2Q2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms