Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubl3Q9Z2M6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubl3Q9Z2M6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubl3Q9Z2M6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubl3Q9Z2M6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubl3Q9Z2M6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubl3Q9Z2M6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubl3Q9Z2M6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubl3Q9Z2M6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubl3Q9Z2M6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubl3Q9Z2M6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubl3Q9Z2M6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ubl3Q9Z2M6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubl3Q9Z2M6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubl3Q9Z2M6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubl3Q9Z2M6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubl3Q9Z2M6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubl3Q9Z2M6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubl3Q9Z2M6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubl3Q9Z2M6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubl3Q9Z2M6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubl3Q9Z2M6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubl3Q9Z2M6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubl3Q9Z2M6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubl3Q9Z2M6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubl3Q9Z2M6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubl3Q9Z2M6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubl3Q9Z2M6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubl3Q9Z2M6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms