Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd2Q9Z2E1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd2Q9Z2E1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd2Q9Z2E1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd2Q9Z2E1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd2Q9Z2E1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd2Q9Z2E1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mbd2Q9Z2E1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mbd2Q9Z2E1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mbd2Q9Z2E1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mbd2Q9Z2E1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mbd2Q9Z2E1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd2Q9Z2E1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd2Q9Z2E1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd2Q9Z2E1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms