Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X2

Ptdss2, Phosphatidylserine synthase 2, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptdss2Q9Z1X2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptdss2Q9Z1X2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptdss2Q9Z1X2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptdss2Q9Z1X2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptdss2Q9Z1X2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptdss2Q9Z1X2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptdss2Q9Z1X2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptdss2Q9Z1X2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptdss2Q9Z1X2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptdss2Q9Z1X2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptdss2Q9Z1X2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptdss2Q9Z1X2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptdss2Q9Z1X2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptdss2Q9Z1X2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptdss2Q9Z1X2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptdss2Q9Z1X2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptdss2Q9Z1X2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptdss2Q9Z1X2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptdss2Q9Z1X2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptdss2Q9Z1X2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptdss2Q9Z1X2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptdss2Q9Z1X2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptdss2Q9Z1X2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptdss2Q9Z1X2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptdss2Q9Z1X2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptdss2Q9Z1X2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ptdss2Q9Z1X2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptdss2Q9Z1X2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptdss2Q9Z1X2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptdss2Q9Z1X2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptdss2Q9Z1X2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptdss2Q9Z1X2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptdss2Q9Z1X2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptdss2Q9Z1X2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptdss2Q9Z1X2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptdss2Q9Z1X2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptdss2Q9Z1X2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptdss2Q9Z1X2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptdss2Q9Z1X2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptdss2Q9Z1X2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms