Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna2d3Q9Z1L5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna2d3Q9Z1L5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna2d3Q9Z1L5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d3Q9Z1L5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms