Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1K5

Arih1, E3 ubiquitin-protein ligase ARIH1, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arih1Q9Z1K5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Arih1Q9Z1K5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Arih1Q9Z1K5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Arih1Q9Z1K5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Arih1Q9Z1K5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Arih1Q9Z1K5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Arih1Q9Z1K5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Arih1Q9Z1K5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Arih1Q9Z1K5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Arih1Q9Z1K5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Arih1Q9Z1K5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Arih1Q9Z1K5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Arih1Q9Z1K5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Arih1Q9Z1K5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Arih1Q9Z1K5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Arih1Q9Z1K5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Arih1Q9Z1K5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Arih1Q9Z1K5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Arih1Q9Z1K5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Arih1Q9Z1K5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Arih1Q9Z1K5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Arih1Q9Z1K5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Arih1Q9Z1K5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Arih1Q9Z1K5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Arih1Q9Z1K5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Arih1Q9Z1K5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Arih1Q9Z1K5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Arih1Q9Z1K5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Arih1Q9Z1K5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Arih1Q9Z1K5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Arih1Q9Z1K5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Arih1Q9Z1K5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Arih1Q9Z1K5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Arih1Q9Z1K5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Arih1Q9Z1K5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Arih1Q9Z1K5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Arih1Q9Z1K5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Arih1Q9Z1K5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Arih1Q9Z1K5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Arih1Q9Z1K5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Arih1Q9Z1K5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Arih1Q9Z1K5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Arih1Q9Z1K5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Arih1Q9Z1K5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Arih1Q9Z1K5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Arih1Q9Z1K5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Arih1Q9Z1K5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Arih1Q9Z1K5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Arih1Q9Z1K5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Arih1Q9Z1K5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Arih1Q9Z1K5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Arih1Q9Z1K5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Arih1Q9Z1K5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Arih1Q9Z1K5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Arih1Q9Z1K5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Arih1Q9Z1K5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Arih1Q9Z1K5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Arih1Q9Z1K5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Arih1Q9Z1K5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Arih1Q9Z1K5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Arih1Q9Z1K5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Arih1Q9Z1K5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Arih1Q9Z1K5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Arih1Q9Z1K5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arih1Q9Z1K5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arih1Q9Z1K5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arih1Q9Z1K5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arih1Q9Z1K5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arih1Q9Z1K5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arih1Q9Z1K5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Arih1Q9Z1K5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Arih1Q9Z1K5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Arih1Q9Z1K5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Arih1Q9Z1K5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Arih1Q9Z1K5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Arih1Q9Z1K5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Arih1Q9Z1K5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Arih1Q9Z1K5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Arih1Q9Z1K5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Arih1Q9Z1K5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Arih1Q9Z1K5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Arih1Q9Z1K5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Arih1Q9Z1K5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Arih1Q9Z1K5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Arih1Q9Z1K5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Arih1Q9Z1K5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Arih1Q9Z1K5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Arih1Q9Z1K5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Arih1Q9Z1K5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Arih1Q9Z1K5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Arih1Q9Z1K5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Arih1Q9Z1K5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Arih1Q9Z1K5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Arih1Q9Z1K5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Arih1Q9Z1K5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Arih1Q9Z1K5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Arih1Q9Z1K5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Arih1Q9Z1K5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Arih1Q9Z1K5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Arih1Q9Z1K5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms