Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Padi1Q9Z185 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Padi1Q9Z185 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Padi1Q9Z185 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Padi1Q9Z185 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Padi1Q9Z185 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Padi1Q9Z185 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Padi1Q9Z185 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Padi1Q9Z185 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Padi1Q9Z185 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Padi1Q9Z185 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Padi1Q9Z185 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Padi1Q9Z185 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Padi1Q9Z185 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Padi1Q9Z185 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Padi1Q9Z185 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Padi1Q9Z185 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Padi1Q9Z185 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Padi1Q9Z185 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Padi1Q9Z185 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Padi1Q9Z185 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Padi1Q9Z185 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Padi1Q9Z185 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Padi1Q9Z185 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Padi1Q9Z185 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Padi1Q9Z185 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Padi1Q9Z185 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Padi1Q9Z185 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Padi1Q9Z185 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Padi1Q9Z185 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Padi1Q9Z185 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Padi1Q9Z185 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Padi1Q9Z185 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Padi1Q9Z185 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Padi1Q9Z185 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Padi1Q9Z185 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Padi1Q9Z185 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms