Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf15Q9Z0J7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf15Q9Z0J7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf15Q9Z0J7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdf15Q9Z0J7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdf15Q9Z0J7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdf15Q9Z0J7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdf15Q9Z0J7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdf15Q9Z0J7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms